Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP58Q9BVL2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms