Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms