Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABRG3Q99928 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms