Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms