Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms