Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PCCA-214ENST00000637358 1533 ntTSL 54.89□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CSTF1-202ENST00000415828 1236 ntTSL 24.24□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CSTF1-207ENST00000498689 585 ntTSL 1 (best)4.24□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PUS7-205ENST00000482157 395 ntTSL 54.07□□□□□ -1.761e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP63-209ENST00000511574 629 ntTSL 43.97□□□□□ -1.771e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 EIF4A3-202ENST00000570625 562 ntTSL 23.85□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.861e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ATAD1-203ENST00000495903 671 ntTSL 33.26□□□□□ -1.891e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP95-208ENST00000579637 494 ntTSL 43.17□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ATP23-203ENST00000549257 519 ntTSL 53.08□□□□□ -1.921e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP95-219ENST00000584857 563 ntTSL 32.8□□□□□ -1.961e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -21e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP95-207ENST00000579478 541 ntTSL 22.43□□□□□ -2.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RAD18-206ENST00000427329 557 ntTSL 32.13□□□□□ -2.071e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP95-206ENST00000579117 574 ntTSL 22.05□□□□□ -2.081e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.111e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 LONRF1-204ENST00000526610 622 ntTSL 31.78□□□□□ -2.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP95-217ENST00000583457 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 30.95□□□□□ -2.261e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SLC22A23-207ENST00000467177 1221 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SLC22A23-209ENST00000485307 1574 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 55.93□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SETD5-228ENST00000493918 4861 ntTSL 1 (best)7.09□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.192e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 220.79■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 216.62■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-201ENST00000239117 555 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-212ENST00000472764 847 ntTSL 57.23□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 INTS6-213ENST00000486195 555 ntTSL 423.84■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 INTS6-216ENST00000491189 496 ntTSL 413.11□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 INTS6-207ENST00000469430 3767 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 INTS6-206ENST00000466784 559 ntTSL 35.92□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.138e-7■■■■■ 35.2
TBRG4Q969Z0 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 35.1
TBRG4Q969Z0 MAU2-202ENST00000262816 3838 ntTSL 210.63□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 MAU2-208ENST00000587709 3751 ntTSL 210.34□□□□□ -0.752e-11■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 MAU2-209ENST00000587938 3695 ntTSL 59.89□□□□□ -0.832e-11■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 TSPAN9-203ENST00000431374 558 ntTSL 414.97□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 FREM1-201ENST00000380875 6126 ntTSL 1 (best)10.1□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 35
TBRG4Q969Z0 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 34.9
TBRG4Q969Z0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 34.9
TBRG4Q969Z0 SLC22A23-211ENST00000496753 561 ntTSL 411.32□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 34.9
TBRG4Q969Z0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 34.9
TBRG4Q969Z0 EXT1-203ENST00000437196 1446 ntTSL 513.43□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 34.9
TBRG4Q969Z0 EXT1-202ENST00000436216 700 ntTSL 312.09□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 34.9
TBRG4Q969Z0 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 56.24□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 34.9
TBRG4Q969Z0 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.369e-8■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 SEPT9-247ENST00000593189 817 ntTSL 511.04□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 SESTD1-204ENST00000435047 681 ntTSL 311.53□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 SESTD1-205ENST00000440010 619 ntTSL 32.16□□□□□ -2.062e-6■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 226.89■■□□□ 1.97e-7■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.637e-7■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.217e-7■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 319.33■□□□□ 0.687e-7■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 517.71■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 214.8□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 314.28□□□□□ -0.127e-7■■■■■ 34.8
TBRG4Q969Z0 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 511.62□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 34.7
TBRG4Q969Z0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 34.7
TBRG4Q969Z0 PLEKHA1-206ENST00000463663 617 ntTSL 524.26■■□□□ 1.472e-6■■■■■ 34.7
TBRG4Q969Z0 PLEKHA1-208ENST00000494222 603 ntTSL 319.92■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 34.7
TBRG4Q969Z0 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 34.7
TBRG4Q969Z0 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 34.7
TBRG4Q969Z0 CD99-208ENST00000482405 842 ntTSL 220.45■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 CD99-206ENST00000449611 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.52■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 518.66■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 516.27■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 57.82□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 34.6
TBRG4Q969Z0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 34.6
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 178.1 ms