Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms