Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms