Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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C9orf40Q8IXQ3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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C9orf40Q8IXQ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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C9orf40Q8IXQ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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C9orf40Q8IXQ3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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C9orf40Q8IXQ3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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C9orf40Q8IXQ3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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