Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms