Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms