Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms