Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UQCC3Q6UW78 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms