Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms