Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms