Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms