Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms