Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms