Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms