Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms