Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXN4Q5MJ08 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms