Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms