Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms