Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SP6Q3SY56 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SP6Q3SY56 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SP6Q3SY56 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SP6Q3SY56 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SP6Q3SY56 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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