Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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GRIK5Q16478 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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GRIK5Q16478 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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