Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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SSX1Q16384 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SSX1Q16384 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SSX1Q16384 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SSX1Q16384 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SSX1Q16384 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SSX1Q16384 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SSX1Q16384 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SSX1Q16384 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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