Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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