Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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