Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms