Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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