Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms