Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF235Q14590 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF235Q14590 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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