Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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