Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD4Q13485 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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