Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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CTBP1Q13363 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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