Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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