Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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