Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SREBF2Q12772 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms