Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms