Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms