Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms