Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms