Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms