Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms