Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHDQ02161 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHDQ02161 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms