Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms