Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms