Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX6P78412 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX6P78412 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms