Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms