Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms